Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CENPJQ9HC77 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CENPJQ9HC77 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CENPJQ9HC77 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CENPJQ9HC77 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CENPJQ9HC77 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CENPJQ9HC77 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CENPJQ9HC77 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CENPJQ9HC77 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CENPJQ9HC77 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CENPJQ9HC77 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CENPJQ9HC77 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CENPJQ9HC77 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CENPJQ9HC77 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CENPJQ9HC77 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CENPJQ9HC77 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CENPJQ9HC77 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CENPJQ9HC77 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CENPJQ9HC77 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CENPJQ9HC77 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CENPJQ9HC77 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CENPJQ9HC77 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CENPJQ9HC77 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CENPJQ9HC77 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CENPJQ9HC77 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CENPJQ9HC77 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CENPJQ9HC77 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CENPJQ9HC77 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CENPJQ9HC77 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CENPJQ9HC77 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CENPJQ9HC77 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CENPJQ9HC77 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CENPJQ9HC77 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CENPJQ9HC77 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CENPJQ9HC77 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CENPJQ9HC77 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CENPJQ9HC77 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CENPJQ9HC77 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CENPJQ9HC77 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CENPJQ9HC77 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CENPJQ9HC77 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CENPJQ9HC77 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CENPJQ9HC77 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CENPJQ9HC77 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CENPJQ9HC77 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CENPJQ9HC77 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CENPJQ9HC77 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms