Protein–RNA interactions for Protein: Q9H422

HIPK3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIPK3Q9H422 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HIPK3Q9H422 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HIPK3Q9H422 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms