Protein–RNA interactions for Protein: Q9H040

SPRTN, SprT-like domain-containing protein Spartan, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRTNQ9H040 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SPRTNQ9H040 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms