Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU1

MCOLN1, Mucolipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN1Q9GZU1 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MCOLN1Q9GZU1 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MCOLN1Q9GZU1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MCOLN1Q9GZU1 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCOLN1Q9GZU1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MCOLN1Q9GZU1 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCOLN1Q9GZU1 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCOLN1Q9GZU1 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCOLN1Q9GZU1 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MCOLN1Q9GZU1 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCOLN1Q9GZU1 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MCOLN1Q9GZU1 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCOLN1Q9GZU1 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCOLN1Q9GZU1 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCOLN1Q9GZU1 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCOLN1Q9GZU1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCOLN1Q9GZU1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MCOLN1Q9GZU1 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCOLN1Q9GZU1 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCOLN1Q9GZU1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCOLN1Q9GZU1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCOLN1Q9GZU1 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCOLN1Q9GZU1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCOLN1Q9GZU1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCOLN1Q9GZU1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCOLN1Q9GZU1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCOLN1Q9GZU1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCOLN1Q9GZU1 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCOLN1Q9GZU1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCOLN1Q9GZU1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCOLN1Q9GZU1 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCOLN1Q9GZU1 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCOLN1Q9GZU1 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCOLN1Q9GZU1 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCOLN1Q9GZU1 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCOLN1Q9GZU1 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCOLN1Q9GZU1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCOLN1Q9GZU1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCOLN1Q9GZU1 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCOLN1Q9GZU1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCOLN1Q9GZU1 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCOLN1Q9GZU1 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCOLN1Q9GZU1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCOLN1Q9GZU1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCOLN1Q9GZU1 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCOLN1Q9GZU1 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCOLN1Q9GZU1 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCOLN1Q9GZU1 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MCOLN1Q9GZU1 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MCOLN1Q9GZU1 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCOLN1Q9GZU1 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCOLN1Q9GZU1 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCOLN1Q9GZU1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCOLN1Q9GZU1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCOLN1Q9GZU1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCOLN1Q9GZU1 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCOLN1Q9GZU1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCOLN1Q9GZU1 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCOLN1Q9GZU1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCOLN1Q9GZU1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCOLN1Q9GZU1 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCOLN1Q9GZU1 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCOLN1Q9GZU1 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCOLN1Q9GZU1 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCOLN1Q9GZU1 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCOLN1Q9GZU1 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCOLN1Q9GZU1 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCOLN1Q9GZU1 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCOLN1Q9GZU1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCOLN1Q9GZU1 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCOLN1Q9GZU1 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCOLN1Q9GZU1 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCOLN1Q9GZU1 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCOLN1Q9GZU1 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MCOLN1Q9GZU1 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MCOLN1Q9GZU1 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCOLN1Q9GZU1 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCOLN1Q9GZU1 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCOLN1Q9GZU1 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCOLN1Q9GZU1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCOLN1Q9GZU1 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCOLN1Q9GZU1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCOLN1Q9GZU1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms