Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K1

SLC39A8, Zinc transporter ZIP8, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A8Q9C0K1 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC39A8Q9C0K1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC39A8Q9C0K1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC39A8Q9C0K1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC39A8Q9C0K1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC39A8Q9C0K1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC39A8Q9C0K1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC39A8Q9C0K1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC39A8Q9C0K1 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC39A8Q9C0K1 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC39A8Q9C0K1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC39A8Q9C0K1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC39A8Q9C0K1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC39A8Q9C0K1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC39A8Q9C0K1 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC39A8Q9C0K1 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC39A8Q9C0K1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC39A8Q9C0K1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SLC39A8Q9C0K1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC39A8Q9C0K1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC39A8Q9C0K1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC39A8Q9C0K1 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC39A8Q9C0K1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC39A8Q9C0K1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC39A8Q9C0K1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC39A8Q9C0K1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC39A8Q9C0K1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC39A8Q9C0K1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC39A8Q9C0K1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC39A8Q9C0K1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC39A8Q9C0K1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC39A8Q9C0K1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC39A8Q9C0K1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC39A8Q9C0K1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC39A8Q9C0K1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SLC39A8Q9C0K1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC39A8Q9C0K1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC39A8Q9C0K1 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC39A8Q9C0K1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC39A8Q9C0K1 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC39A8Q9C0K1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC39A8Q9C0K1 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC39A8Q9C0K1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC39A8Q9C0K1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC39A8Q9C0K1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC39A8Q9C0K1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC39A8Q9C0K1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC39A8Q9C0K1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC39A8Q9C0K1 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SLC39A8Q9C0K1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC39A8Q9C0K1 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC39A8Q9C0K1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC39A8Q9C0K1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC39A8Q9C0K1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC39A8Q9C0K1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC39A8Q9C0K1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC39A8Q9C0K1 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC39A8Q9C0K1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC39A8Q9C0K1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SLC39A8Q9C0K1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC39A8Q9C0K1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC39A8Q9C0K1 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC39A8Q9C0K1 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC39A8Q9C0K1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC39A8Q9C0K1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC39A8Q9C0K1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC39A8Q9C0K1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SLC39A8Q9C0K1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC39A8Q9C0K1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC39A8Q9C0K1 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC39A8Q9C0K1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC39A8Q9C0K1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC39A8Q9C0K1 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC39A8Q9C0K1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC39A8Q9C0K1 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC39A8Q9C0K1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC39A8Q9C0K1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC39A8Q9C0K1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC39A8Q9C0K1 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC39A8Q9C0K1 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC39A8Q9C0K1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC39A8Q9C0K1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC39A8Q9C0K1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC39A8Q9C0K1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC39A8Q9C0K1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC39A8Q9C0K1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC39A8Q9C0K1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC39A8Q9C0K1 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC39A8Q9C0K1 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC39A8Q9C0K1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SLC39A8Q9C0K1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC39A8Q9C0K1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC39A8Q9C0K1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC39A8Q9C0K1 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC39A8Q9C0K1 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC39A8Q9C0K1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC39A8Q9C0K1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC39A8Q9C0K1 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC39A8Q9C0K1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SLC39A8Q9C0K1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms