Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PHACTR1Q9C0D0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms