Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
TRIM4Q9C037 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms