Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GABARAPL3Q9BY60 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GABARAPL3Q9BY60 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms