Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RSPO3Q9BXY4 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms