Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC106Q9BWC9 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms