Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCDC94Q9BW85 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCDC94Q9BW85 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms