Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
HIRIP3Q9BW71 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HIRIP3Q9BW71 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms