Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TINF2Q9BSI4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms