Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
MESP1Q9BRJ9 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
MESP1Q9BRJ9 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MESP1Q9BRJ9 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MESP1Q9BRJ9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
MESP1Q9BRJ9 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
MESP1Q9BRJ9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
MESP1Q9BRJ9 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms