Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW4

APOL4, Apolipoprotein L4, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL4Q9BPW4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
APOL4Q9BPW4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms