Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SEMA3CQ99985 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEMA3CQ99985 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms