Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

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Length 193 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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CITED1Q99966 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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CITED1Q99966 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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CITED1Q99966 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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CITED1Q99966 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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CITED1Q99966 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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CITED1Q99966 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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CITED1Q99966 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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CITED1Q99966 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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CITED1Q99966 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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CITED1Q99966 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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CITED1Q99966 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CITED1Q99966 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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