Protein–RNA interactions for Protein: Q99928

GABRG3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRG3Q99928 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GABRG3Q99928 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GABRG3Q99928 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GABRG3Q99928 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GABRG3Q99928 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GABRG3Q99928 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GABRG3Q99928 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABRG3Q99928 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABRG3Q99928 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GABRG3Q99928 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABRG3Q99928 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABRG3Q99928 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABRG3Q99928 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABRG3Q99928 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABRG3Q99928 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABRG3Q99928 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABRG3Q99928 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABRG3Q99928 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABRG3Q99928 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GABRG3Q99928 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GABRG3Q99928 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABRG3Q99928 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABRG3Q99928 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABRG3Q99928 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABRG3Q99928 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GABRG3Q99928 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GABRG3Q99928 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
GABRG3Q99928 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
GABRG3Q99928 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GABRG3Q99928 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms