Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MEIS3Q99687 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms