Protein–RNA interactions for Protein: Q96T23

RSF1, Remodeling and spacing factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSF1Q96T23 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
RSF1Q96T23 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
RSF1Q96T23 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
RSF1Q96T23 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
RSF1Q96T23 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
RSF1Q96T23 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
RSF1Q96T23 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
RSF1Q96T23 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
RSF1Q96T23 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
RSF1Q96T23 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
RSF1Q96T23 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
RSF1Q96T23 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC36.12■■■■□ 3.37
RSF1Q96T23 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
RSF1Q96T23 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
RSF1Q96T23 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
RSF1Q96T23 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
RSF1Q96T23 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
RSF1Q96T23 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
RSF1Q96T23 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
RSF1Q96T23 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
RSF1Q96T23 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
RSF1Q96T23 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
RSF1Q96T23 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
RSF1Q96T23 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
RSF1Q96T23 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
RSF1Q96T23 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
RSF1Q96T23 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC36.1■■■■□ 3.37
RSF1Q96T23 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
RSF1Q96T23 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
RSF1Q96T23 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
RSF1Q96T23 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
RSF1Q96T23 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC36.09■■■■□ 3.37
RSF1Q96T23 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
RSF1Q96T23 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
RSF1Q96T23 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
RSF1Q96T23 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC36.09■■■■□ 3.37
RSF1Q96T23 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
RSF1Q96T23 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
RSF1Q96T23 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
RSF1Q96T23 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
RSF1Q96T23 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
RSF1Q96T23 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
RSF1Q96T23 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
RSF1Q96T23 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
RSF1Q96T23 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
RSF1Q96T23 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
RSF1Q96T23 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
RSF1Q96T23 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
RSF1Q96T23 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
RSF1Q96T23 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
RSF1Q96T23 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
RSF1Q96T23 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
RSF1Q96T23 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
RSF1Q96T23 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
RSF1Q96T23 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
RSF1Q96T23 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
RSF1Q96T23 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
RSF1Q96T23 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
RSF1Q96T23 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
RSF1Q96T23 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
RSF1Q96T23 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
RSF1Q96T23 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
RSF1Q96T23 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
RSF1Q96T23 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
RSF1Q96T23 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
RSF1Q96T23 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
RSF1Q96T23 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
RSF1Q96T23 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
RSF1Q96T23 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
RSF1Q96T23 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
RSF1Q96T23 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
RSF1Q96T23 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
RSF1Q96T23 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
RSF1Q96T23 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
RSF1Q96T23 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
RSF1Q96T23 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
RSF1Q96T23 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
RSF1Q96T23 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
RSF1Q96T23 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
RSF1Q96T23 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
RSF1Q96T23 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
RSF1Q96T23 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
RSF1Q96T23 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
RSF1Q96T23 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
RSF1Q96T23 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
RSF1Q96T23 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
RSF1Q96T23 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
RSF1Q96T23 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
RSF1Q96T23 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
RSF1Q96T23 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
RSF1Q96T23 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
RSF1Q96T23 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
RSF1Q96T23 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
RSF1Q96T23 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
RSF1Q96T23 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
RSF1Q96T23 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
RSF1Q96T23 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
RSF1Q96T23 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
RSF1Q96T23 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
RSF1Q96T23 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC36.01■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms