Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSPAN18Q96SJ8 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSPAN18Q96SJ8 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSPAN18Q96SJ8 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSPAN18Q96SJ8 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TSPAN18Q96SJ8 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSPAN18Q96SJ8 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSPAN18Q96SJ8 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSPAN18Q96SJ8 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSPAN18Q96SJ8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSPAN18Q96SJ8 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSPAN18Q96SJ8 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TSPAN18Q96SJ8 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TSPAN18Q96SJ8 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSPAN18Q96SJ8 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSPAN18Q96SJ8 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSPAN18Q96SJ8 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSPAN18Q96SJ8 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSPAN18Q96SJ8 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSPAN18Q96SJ8 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSPAN18Q96SJ8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSPAN18Q96SJ8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSPAN18Q96SJ8 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSPAN18Q96SJ8 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSPAN18Q96SJ8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSPAN18Q96SJ8 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TSPAN18Q96SJ8 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSPAN18Q96SJ8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSPAN18Q96SJ8 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSPAN18Q96SJ8 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TSPAN18Q96SJ8 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSPAN18Q96SJ8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSPAN18Q96SJ8 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSPAN18Q96SJ8 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSPAN18Q96SJ8 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSPAN18Q96SJ8 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSPAN18Q96SJ8 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSPAN18Q96SJ8 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSPAN18Q96SJ8 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSPAN18Q96SJ8 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSPAN18Q96SJ8 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSPAN18Q96SJ8 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TSPAN18Q96SJ8 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TSPAN18Q96SJ8 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms