Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS6KC1Q96S38 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS6KC1Q96S38 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms