Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CITED4Q96RK1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CITED4Q96RK1 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CITED4Q96RK1 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CITED4Q96RK1 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CITED4Q96RK1 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CITED4Q96RK1 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CITED4Q96RK1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CITED4Q96RK1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CITED4Q96RK1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CITED4Q96RK1 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CITED4Q96RK1 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CITED4Q96RK1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CITED4Q96RK1 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CITED4Q96RK1 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CITED4Q96RK1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CITED4Q96RK1 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CITED4Q96RK1 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CITED4Q96RK1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CITED4Q96RK1 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CITED4Q96RK1 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CITED4Q96RK1 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CITED4Q96RK1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CITED4Q96RK1 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CITED4Q96RK1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CITED4Q96RK1 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CITED4Q96RK1 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CITED4Q96RK1 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CITED4Q96RK1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CITED4Q96RK1 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CITED4Q96RK1 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CITED4Q96RK1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CITED4Q96RK1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CITED4Q96RK1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CITED4Q96RK1 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CITED4Q96RK1 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CITED4Q96RK1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CITED4Q96RK1 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CITED4Q96RK1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CITED4Q96RK1 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CITED4Q96RK1 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CITED4Q96RK1 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CITED4Q96RK1 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CITED4Q96RK1 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CITED4Q96RK1 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CITED4Q96RK1 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CITED4Q96RK1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CITED4Q96RK1 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CITED4Q96RK1 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CITED4Q96RK1 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CITED4Q96RK1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CITED4Q96RK1 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CITED4Q96RK1 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CITED4Q96RK1 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CITED4Q96RK1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CITED4Q96RK1 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CITED4Q96RK1 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CITED4Q96RK1 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CITED4Q96RK1 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CITED4Q96RK1 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CITED4Q96RK1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CITED4Q96RK1 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CITED4Q96RK1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CITED4Q96RK1 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CITED4Q96RK1 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CITED4Q96RK1 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CITED4Q96RK1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CITED4Q96RK1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CITED4Q96RK1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CITED4Q96RK1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CITED4Q96RK1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CITED4Q96RK1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CITED4Q96RK1 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CITED4Q96RK1 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CITED4Q96RK1 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CITED4Q96RK1 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CITED4Q96RK1 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CITED4Q96RK1 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CITED4Q96RK1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CITED4Q96RK1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CITED4Q96RK1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CITED4Q96RK1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms