Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU5

NEDD4L, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4-like, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4LQ96PU5 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD4LQ96PU5 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD4LQ96PU5 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD4LQ96PU5 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD4LQ96PU5 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD4LQ96PU5 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD4LQ96PU5 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD4LQ96PU5 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD4LQ96PU5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEDD4LQ96PU5 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD4LQ96PU5 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD4LQ96PU5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD4LQ96PU5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD4LQ96PU5 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD4LQ96PU5 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD4LQ96PU5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD4LQ96PU5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD4LQ96PU5 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD4LQ96PU5 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD4LQ96PU5 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD4LQ96PU5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD4LQ96PU5 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD4LQ96PU5 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD4LQ96PU5 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD4LQ96PU5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD4LQ96PU5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD4LQ96PU5 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD4LQ96PU5 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD4LQ96PU5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD4LQ96PU5 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD4LQ96PU5 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD4LQ96PU5 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD4LQ96PU5 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD4LQ96PU5 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD4LQ96PU5 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD4LQ96PU5 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEDD4LQ96PU5 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD4LQ96PU5 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD4LQ96PU5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD4LQ96PU5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD4LQ96PU5 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD4LQ96PU5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD4LQ96PU5 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD4LQ96PU5 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD4LQ96PU5 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD4LQ96PU5 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD4LQ96PU5 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD4LQ96PU5 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD4LQ96PU5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD4LQ96PU5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD4LQ96PU5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD4LQ96PU5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD4LQ96PU5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD4LQ96PU5 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD4LQ96PU5 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD4LQ96PU5 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD4LQ96PU5 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEDD4LQ96PU5 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD4LQ96PU5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD4LQ96PU5 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD4LQ96PU5 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD4LQ96PU5 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD4LQ96PU5 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD4LQ96PU5 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD4LQ96PU5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD4LQ96PU5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD4LQ96PU5 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD4LQ96PU5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD4LQ96PU5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD4LQ96PU5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD4LQ96PU5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD4LQ96PU5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD4LQ96PU5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD4LQ96PU5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD4LQ96PU5 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD4LQ96PU5 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD4LQ96PU5 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD4LQ96PU5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD4LQ96PU5 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEDD4LQ96PU5 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NEDD4LQ96PU5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NEDD4LQ96PU5 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NEDD4LQ96PU5 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD4LQ96PU5 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD4LQ96PU5 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD4LQ96PU5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD4LQ96PU5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD4LQ96PU5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD4LQ96PU5 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD4LQ96PU5 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD4LQ96PU5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD4LQ96PU5 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD4LQ96PU5 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD4LQ96PU5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD4LQ96PU5 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD4LQ96PU5 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD4LQ96PU5 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD4LQ96PU5 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD4LQ96PU5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEDD4LQ96PU5 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms