Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW4

ANKRD27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD27Q96NW4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ANKRD27Q96NW4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms