Protein–RNA interactions for Protein: Q96NG5

ZNF558, Zinc finger protein 558, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF558Q96NG5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF558Q96NG5 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF558Q96NG5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF558Q96NG5 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF558Q96NG5 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF558Q96NG5 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF558Q96NG5 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF558Q96NG5 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF558Q96NG5 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF558Q96NG5 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF558Q96NG5 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF558Q96NG5 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF558Q96NG5 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ZNF558Q96NG5 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF558Q96NG5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF558Q96NG5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF558Q96NG5 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF558Q96NG5 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF558Q96NG5 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF558Q96NG5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF558Q96NG5 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF558Q96NG5 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF558Q96NG5 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF558Q96NG5 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF558Q96NG5 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ZNF558Q96NG5 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF558Q96NG5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF558Q96NG5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF558Q96NG5 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF558Q96NG5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF558Q96NG5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF558Q96NG5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF558Q96NG5 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF558Q96NG5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF558Q96NG5 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF558Q96NG5 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF558Q96NG5 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF558Q96NG5 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF558Q96NG5 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ZNF558Q96NG5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF558Q96NG5 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms