Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SAMD8Q96LT4 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SAMD8Q96LT4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
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