Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC4

ZNF479, Zinc finger protein 479, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF479Q96JC4 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
ZNF479Q96JC4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms