Protein–RNA interactions for Protein: Q96HF1

SFRP2, Secreted frizzled-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP2Q96HF1 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SFRP2Q96HF1 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms