Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SMIM12Q96EX1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SMIM12Q96EX1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms