Protein–RNA interactions for Protein: Q96E11

MRRF, Ribosome-recycling factor, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRRFQ96E11 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MRRFQ96E11 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MRRFQ96E11 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MRRFQ96E11 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MRRFQ96E11 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MRRFQ96E11 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MRRFQ96E11 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
MRRFQ96E11 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MRRFQ96E11 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MRRFQ96E11 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MRRFQ96E11 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MRRFQ96E11 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MRRFQ96E11 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
MRRFQ96E11 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MRRFQ96E11 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MRRFQ96E11 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MRRFQ96E11 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MRRFQ96E11 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MRRFQ96E11 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MRRFQ96E11 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MRRFQ96E11 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MRRFQ96E11 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRRFQ96E11 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRRFQ96E11 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRRFQ96E11 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRRFQ96E11 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRRFQ96E11 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRRFQ96E11 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRRFQ96E11 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRRFQ96E11 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRRFQ96E11 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRRFQ96E11 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
MRRFQ96E11 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRRFQ96E11 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
MRRFQ96E11 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRRFQ96E11 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRRFQ96E11 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRRFQ96E11 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRRFQ96E11 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRRFQ96E11 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRRFQ96E11 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MRRFQ96E11 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRRFQ96E11 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRRFQ96E11 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRRFQ96E11 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRRFQ96E11 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRRFQ96E11 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRRFQ96E11 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRRFQ96E11 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRRFQ96E11 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRRFQ96E11 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRRFQ96E11 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRRFQ96E11 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRRFQ96E11 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRRFQ96E11 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRRFQ96E11 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRRFQ96E11 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRRFQ96E11 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRRFQ96E11 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRRFQ96E11 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRRFQ96E11 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRRFQ96E11 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRRFQ96E11 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MRRFQ96E11 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
MRRFQ96E11 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms