Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SPTSSAQ969W0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms