Protein–RNA interactions for Protein: Q93099

HGD, Homogentisate 1,2-dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HGDQ93099 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HGDQ93099 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HGDQ93099 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HGDQ93099 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HGDQ93099 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HGDQ93099 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HGDQ93099 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HGDQ93099 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HGDQ93099 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HGDQ93099 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HGDQ93099 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HGDQ93099 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
HGDQ93099 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HGDQ93099 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HGDQ93099 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HGDQ93099 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HGDQ93099 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HGDQ93099 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HGDQ93099 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HGDQ93099 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HGDQ93099 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HGDQ93099 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HGDQ93099 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HGDQ93099 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HGDQ93099 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HGDQ93099 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HGDQ93099 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HGDQ93099 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HGDQ93099 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HGDQ93099 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HGDQ93099 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HGDQ93099 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HGDQ93099 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HGDQ93099 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HGDQ93099 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HGDQ93099 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HGDQ93099 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HGDQ93099 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HGDQ93099 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HGDQ93099 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HGDQ93099 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HGDQ93099 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HGDQ93099 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HGDQ93099 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HGDQ93099 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HGDQ93099 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HGDQ93099 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HGDQ93099 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HGDQ93099 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HGDQ93099 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HGDQ93099 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HGDQ93099 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HGDQ93099 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HGDQ93099 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HGDQ93099 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HGDQ93099 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HGDQ93099 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HGDQ93099 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HGDQ93099 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HGDQ93099 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HGDQ93099 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HGDQ93099 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HGDQ93099 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HGDQ93099 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HGDQ93099 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HGDQ93099 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HGDQ93099 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HGDQ93099 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HGDQ93099 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HGDQ93099 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HGDQ93099 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HGDQ93099 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HGDQ93099 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HGDQ93099 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HGDQ93099 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HGDQ93099 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HGDQ93099 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HGDQ93099 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HGDQ93099 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HGDQ93099 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HGDQ93099 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HGDQ93099 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HGDQ93099 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HGDQ93099 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HGDQ93099 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HGDQ93099 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HGDQ93099 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HGDQ93099 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HGDQ93099 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HGDQ93099 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HGDQ93099 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HGDQ93099 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HGDQ93099 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HGDQ93099 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HGDQ93099 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HGDQ93099 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HGDQ93099 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HGDQ93099 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HGDQ93099 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HGDQ93099 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms