Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
HERVK_113Q902F9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HERVK_113Q902F9 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HERVK_113Q902F9 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HERVK_113Q902F9 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HERVK_113Q902F9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HERVK_113Q902F9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HERVK_113Q902F9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HERVK_113Q902F9 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HERVK_113Q902F9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERVK_113Q902F9 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERVK_113Q902F9 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERVK_113Q902F9 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERVK_113Q902F9 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERVK_113Q902F9 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HERVK_113Q902F9 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERVK_113Q902F9 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERVK_113Q902F9 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERVK_113Q902F9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERVK_113Q902F9 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERVK_113Q902F9 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERVK_113Q902F9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERVK_113Q902F9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HERVK_113Q902F9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERVK_113Q902F9 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERVK_113Q902F9 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERVK_113Q902F9 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERVK_113Q902F9 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HERVK_113Q902F9 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HERVK_113Q902F9 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HERVK_113Q902F9 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERVK_113Q902F9 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERVK_113Q902F9 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERVK_113Q902F9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERVK_113Q902F9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERVK_113Q902F9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HERVK_113Q902F9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERVK_113Q902F9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERVK_113Q902F9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERVK_113Q902F9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERVK_113Q902F9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERVK_113Q902F9 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERVK_113Q902F9 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERVK_113Q902F9 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERVK_113Q902F9 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERVK_113Q902F9 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERVK_113Q902F9 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HERVK_113Q902F9 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms