Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWY3

PRPF31, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF31Q8WWY3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF31Q8WWY3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF31Q8WWY3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF31Q8WWY3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF31Q8WWY3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF31Q8WWY3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF31Q8WWY3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF31Q8WWY3 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF31Q8WWY3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF31Q8WWY3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF31Q8WWY3 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF31Q8WWY3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF31Q8WWY3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRPF31Q8WWY3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PRPF31Q8WWY3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PRPF31Q8WWY3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRPF31Q8WWY3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms