Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUI4

HDAC7, Histone deacetylase 7, humanhuman

Predictions only

Length 952 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC7Q8WUI4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HDAC7Q8WUI4 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
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