Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUA8

TSKU, Tsukushin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKUQ8WUA8 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TSKUQ8WUA8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TSKUQ8WUA8 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms