Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DDX54Q8TDD1 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDX54Q8TDD1 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms