Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC148Q8NFR7 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC148Q8NFR7 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms