Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF397Q8NF99 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms