Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7E2

ZNF645, E3 ubiquitin-protein ligase ZNF645, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF645Q8N7E2 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF645Q8N7E2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF645Q8N7E2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF645Q8N7E2 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF645Q8N7E2 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF645Q8N7E2 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ZNF645Q8N7E2 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF645Q8N7E2 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF645Q8N7E2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF645Q8N7E2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF645Q8N7E2 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF645Q8N7E2 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF645Q8N7E2 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF645Q8N7E2 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF645Q8N7E2 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF645Q8N7E2 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF645Q8N7E2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF645Q8N7E2 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF645Q8N7E2 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF645Q8N7E2 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF645Q8N7E2 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF645Q8N7E2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF645Q8N7E2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF645Q8N7E2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF645Q8N7E2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF645Q8N7E2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF645Q8N7E2 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF645Q8N7E2 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF645Q8N7E2 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF645Q8N7E2 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZNF645Q8N7E2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF645Q8N7E2 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF645Q8N7E2 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF645Q8N7E2 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZNF645Q8N7E2 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF645Q8N7E2 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF645Q8N7E2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF645Q8N7E2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF645Q8N7E2 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF645Q8N7E2 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF645Q8N7E2 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF645Q8N7E2 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF645Q8N7E2 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF645Q8N7E2 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF645Q8N7E2 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF645Q8N7E2 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF645Q8N7E2 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF645Q8N7E2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF645Q8N7E2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF645Q8N7E2 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF645Q8N7E2 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF645Q8N7E2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF645Q8N7E2 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF645Q8N7E2 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF645Q8N7E2 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF645Q8N7E2 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF645Q8N7E2 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF645Q8N7E2 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF645Q8N7E2 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZNF645Q8N7E2 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF645Q8N7E2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF645Q8N7E2 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF645Q8N7E2 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF645Q8N7E2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF645Q8N7E2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF645Q8N7E2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF645Q8N7E2 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF645Q8N7E2 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF645Q8N7E2 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF645Q8N7E2 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF645Q8N7E2 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF645Q8N7E2 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF645Q8N7E2 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF645Q8N7E2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF645Q8N7E2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF645Q8N7E2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF645Q8N7E2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF645Q8N7E2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF645Q8N7E2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF645Q8N7E2 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF645Q8N7E2 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF645Q8N7E2 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF645Q8N7E2 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF645Q8N7E2 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF645Q8N7E2 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF645Q8N7E2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF645Q8N7E2 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF645Q8N7E2 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZNF645Q8N7E2 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF645Q8N7E2 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF645Q8N7E2 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF645Q8N7E2 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF645Q8N7E2 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF645Q8N7E2 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF645Q8N7E2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF645Q8N7E2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF645Q8N7E2 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF645Q8N7E2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF645Q8N7E2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ZNF645Q8N7E2 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms