Protein–RNA interactions for Protein: Q86XT4

TRIM50, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM50, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM50Q86XT4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM50Q86XT4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM50Q86XT4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM50Q86XT4 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM50Q86XT4 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM50Q86XT4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM50Q86XT4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM50Q86XT4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM50Q86XT4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM50Q86XT4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM50Q86XT4 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM50Q86XT4 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM50Q86XT4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM50Q86XT4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM50Q86XT4 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM50Q86XT4 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM50Q86XT4 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM50Q86XT4 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM50Q86XT4 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM50Q86XT4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM50Q86XT4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM50Q86XT4 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM50Q86XT4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM50Q86XT4 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM50Q86XT4 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM50Q86XT4 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM50Q86XT4 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM50Q86XT4 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM50Q86XT4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM50Q86XT4 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM50Q86XT4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM50Q86XT4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM50Q86XT4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM50Q86XT4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM50Q86XT4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM50Q86XT4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM50Q86XT4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM50Q86XT4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM50Q86XT4 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM50Q86XT4 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM50Q86XT4 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM50Q86XT4 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM50Q86XT4 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM50Q86XT4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM50Q86XT4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM50Q86XT4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM50Q86XT4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM50Q86XT4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM50Q86XT4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM50Q86XT4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM50Q86XT4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM50Q86XT4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM50Q86XT4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM50Q86XT4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM50Q86XT4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM50Q86XT4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM50Q86XT4 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM50Q86XT4 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM50Q86XT4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM50Q86XT4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM50Q86XT4 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM50Q86XT4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM50Q86XT4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM50Q86XT4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM50Q86XT4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM50Q86XT4 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM50Q86XT4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM50Q86XT4 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM50Q86XT4 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM50Q86XT4 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM50Q86XT4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIM50Q86XT4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM50Q86XT4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM50Q86XT4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM50Q86XT4 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM50Q86XT4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM50Q86XT4 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM50Q86XT4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM50Q86XT4 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM50Q86XT4 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM50Q86XT4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM50Q86XT4 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM50Q86XT4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM50Q86XT4 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM50Q86XT4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM50Q86XT4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM50Q86XT4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIM50Q86XT4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRIM50Q86XT4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRIM50Q86XT4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRIM50Q86XT4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM50Q86XT4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM50Q86XT4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM50Q86XT4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM50Q86XT4 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM50Q86XT4 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM50Q86XT4 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM50Q86XT4 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM50Q86XT4 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM50Q86XT4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms