Protein–RNA interactions for Protein: Q86V35

CABP7, Calcium-binding protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP7Q86V35 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CABP7Q86V35 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CABP7Q86V35 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CABP7Q86V35 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CABP7Q86V35 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CABP7Q86V35 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CABP7Q86V35 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CABP7Q86V35 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CABP7Q86V35 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CABP7Q86V35 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CABP7Q86V35 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CABP7Q86V35 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CABP7Q86V35 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CABP7Q86V35 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CABP7Q86V35 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CABP7Q86V35 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CABP7Q86V35 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CABP7Q86V35 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CABP7Q86V35 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CABP7Q86V35 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CABP7Q86V35 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CABP7Q86V35 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CABP7Q86V35 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CABP7Q86V35 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CABP7Q86V35 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CABP7Q86V35 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CABP7Q86V35 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CABP7Q86V35 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CABP7Q86V35 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CABP7Q86V35 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CABP7Q86V35 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CABP7Q86V35 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CABP7Q86V35 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CABP7Q86V35 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CABP7Q86V35 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CABP7Q86V35 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CABP7Q86V35 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CABP7Q86V35 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CABP7Q86V35 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CABP7Q86V35 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CABP7Q86V35 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CABP7Q86V35 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CABP7Q86V35 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CABP7Q86V35 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CABP7Q86V35 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CABP7Q86V35 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CABP7Q86V35 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CABP7Q86V35 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CABP7Q86V35 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CABP7Q86V35 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CABP7Q86V35 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CABP7Q86V35 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CABP7Q86V35 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CABP7Q86V35 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CABP7Q86V35 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CABP7Q86V35 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CABP7Q86V35 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CABP7Q86V35 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CABP7Q86V35 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CABP7Q86V35 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CABP7Q86V35 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CABP7Q86V35 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CABP7Q86V35 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CABP7Q86V35 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CABP7Q86V35 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CABP7Q86V35 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CABP7Q86V35 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CABP7Q86V35 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CABP7Q86V35 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CABP7Q86V35 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CABP7Q86V35 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CABP7Q86V35 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CABP7Q86V35 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CABP7Q86V35 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CABP7Q86V35 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CABP7Q86V35 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CABP7Q86V35 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CABP7Q86V35 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CABP7Q86V35 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CABP7Q86V35 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CABP7Q86V35 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CABP7Q86V35 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CABP7Q86V35 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CABP7Q86V35 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CABP7Q86V35 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CABP7Q86V35 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CABP7Q86V35 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CABP7Q86V35 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CABP7Q86V35 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CABP7Q86V35 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CABP7Q86V35 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CABP7Q86V35 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CABP7Q86V35 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CABP7Q86V35 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CABP7Q86V35 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CABP7Q86V35 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CABP7Q86V35 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CABP7Q86V35 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CABP7Q86V35 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CABP7Q86V35 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms