Protein–RNA interactions for Protein: Q86U37

LINC01551, Uncharacterized protein encoded by LINC01551, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01551Q86U37 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC01551Q86U37 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms