Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Z0

KRT25, Keratin, type I cytoskeletal 25, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT25Q7Z3Z0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT25Q7Z3Z0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT25Q7Z3Z0 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT25Q7Z3Z0 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT25Q7Z3Z0 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT25Q7Z3Z0 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT25Q7Z3Z0 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT25Q7Z3Z0 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT25Q7Z3Z0 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT25Q7Z3Z0 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT25Q7Z3Z0 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT25Q7Z3Z0 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT25Q7Z3Z0 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT25Q7Z3Z0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT25Q7Z3Z0 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT25Q7Z3Z0 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms