Protein–RNA interactions for Protein: Q70Z35

PREX2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREX2Q70Z35 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PREX2Q70Z35 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PREX2Q70Z35 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PREX2Q70Z35 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PREX2Q70Z35 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PREX2Q70Z35 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PREX2Q70Z35 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PREX2Q70Z35 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PREX2Q70Z35 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PREX2Q70Z35 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PREX2Q70Z35 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PREX2Q70Z35 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PREX2Q70Z35 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
PREX2Q70Z35 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PREX2Q70Z35 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PREX2Q70Z35 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PREX2Q70Z35 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PREX2Q70Z35 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PREX2Q70Z35 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PREX2Q70Z35 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PREX2Q70Z35 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PREX2Q70Z35 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PREX2Q70Z35 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PREX2Q70Z35 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PREX2Q70Z35 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PREX2Q70Z35 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PREX2Q70Z35 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PREX2Q70Z35 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PREX2Q70Z35 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PREX2Q70Z35 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PREX2Q70Z35 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PREX2Q70Z35 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PREX2Q70Z35 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PREX2Q70Z35 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PREX2Q70Z35 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
PREX2Q70Z35 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PREX2Q70Z35 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PREX2Q70Z35 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PREX2Q70Z35 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PREX2Q70Z35 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
PREX2Q70Z35 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PREX2Q70Z35 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PREX2Q70Z35 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PREX2Q70Z35 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PREX2Q70Z35 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
PREX2Q70Z35 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PREX2Q70Z35 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PREX2Q70Z35 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PREX2Q70Z35 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PREX2Q70Z35 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PREX2Q70Z35 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PREX2Q70Z35 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PREX2Q70Z35 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PREX2Q70Z35 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PREX2Q70Z35 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
PREX2Q70Z35 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PREX2Q70Z35 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PREX2Q70Z35 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
PREX2Q70Z35 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
PREX2Q70Z35 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PREX2Q70Z35 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PREX2Q70Z35 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PREX2Q70Z35 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PREX2Q70Z35 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PREX2Q70Z35 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PREX2Q70Z35 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PREX2Q70Z35 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PREX2Q70Z35 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PREX2Q70Z35 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PREX2Q70Z35 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PREX2Q70Z35 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
PREX2Q70Z35 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PREX2Q70Z35 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PREX2Q70Z35 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PREX2Q70Z35 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PREX2Q70Z35 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PREX2Q70Z35 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PREX2Q70Z35 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PREX2Q70Z35 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PREX2Q70Z35 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PREX2Q70Z35 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PREX2Q70Z35 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PREX2Q70Z35 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PREX2Q70Z35 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PREX2Q70Z35 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
PREX2Q70Z35 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PREX2Q70Z35 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PREX2Q70Z35 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PREX2Q70Z35 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
PREX2Q70Z35 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PREX2Q70Z35 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PREX2Q70Z35 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PREX2Q70Z35 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
PREX2Q70Z35 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PREX2Q70Z35 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PREX2Q70Z35 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
PREX2Q70Z35 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PREX2Q70Z35 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PREX2Q70Z35 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PREX2Q70Z35 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms