Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV77

C9orf139, Uncharacterized protein C9orf139, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf139Q6ZV77 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf139Q6ZV77 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf139Q6ZV77 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf139Q6ZV77 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf139Q6ZV77 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf139Q6ZV77 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf139Q6ZV77 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf139Q6ZV77 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf139Q6ZV77 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf139Q6ZV77 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf139Q6ZV77 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf139Q6ZV77 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf139Q6ZV77 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf139Q6ZV77 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf139Q6ZV77 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf139Q6ZV77 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf139Q6ZV77 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf139Q6ZV77 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf139Q6ZV77 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf139Q6ZV77 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf139Q6ZV77 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf139Q6ZV77 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf139Q6ZV77 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf139Q6ZV77 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf139Q6ZV77 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf139Q6ZV77 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf139Q6ZV77 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf139Q6ZV77 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf139Q6ZV77 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf139Q6ZV77 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf139Q6ZV77 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf139Q6ZV77 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf139Q6ZV77 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf139Q6ZV77 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf139Q6ZV77 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf139Q6ZV77 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf139Q6ZV77 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf139Q6ZV77 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf139Q6ZV77 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf139Q6ZV77 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf139Q6ZV77 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf139Q6ZV77 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf139Q6ZV77 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C9orf139Q6ZV77 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C9orf139Q6ZV77 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C9orf139Q6ZV77 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C9orf139Q6ZV77 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
C9orf139Q6ZV77 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf139Q6ZV77 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf139Q6ZV77 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf139Q6ZV77 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf139Q6ZV77 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf139Q6ZV77 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf139Q6ZV77 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf139Q6ZV77 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf139Q6ZV77 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf139Q6ZV77 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf139Q6ZV77 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf139Q6ZV77 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf139Q6ZV77 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf139Q6ZV77 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf139Q6ZV77 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf139Q6ZV77 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf139Q6ZV77 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf139Q6ZV77 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf139Q6ZV77 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf139Q6ZV77 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf139Q6ZV77 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf139Q6ZV77 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf139Q6ZV77 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf139Q6ZV77 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf139Q6ZV77 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf139Q6ZV77 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf139Q6ZV77 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf139Q6ZV77 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf139Q6ZV77 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf139Q6ZV77 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf139Q6ZV77 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf139Q6ZV77 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf139Q6ZV77 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf139Q6ZV77 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf139Q6ZV77 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf139Q6ZV77 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf139Q6ZV77 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf139Q6ZV77 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf139Q6ZV77 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf139Q6ZV77 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf139Q6ZV77 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf139Q6ZV77 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf139Q6ZV77 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf139Q6ZV77 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf139Q6ZV77 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf139Q6ZV77 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf139Q6ZV77 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf139Q6ZV77 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf139Q6ZV77 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf139Q6ZV77 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf139Q6ZV77 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf139Q6ZV77 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf139Q6ZV77 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms