Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC129Q6ZRS4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC129Q6ZRS4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms