Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC11.74□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
CASC2Q6XLA1 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms