Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY18

LINGO4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO4Q6UY18 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINGO4Q6UY18 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINGO4Q6UY18 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINGO4Q6UY18 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINGO4Q6UY18 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINGO4Q6UY18 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINGO4Q6UY18 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LINGO4Q6UY18 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINGO4Q6UY18 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINGO4Q6UY18 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINGO4Q6UY18 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
LINGO4Q6UY18 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINGO4Q6UY18 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINGO4Q6UY18 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINGO4Q6UY18 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINGO4Q6UY18 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINGO4Q6UY18 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINGO4Q6UY18 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
LINGO4Q6UY18 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINGO4Q6UY18 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINGO4Q6UY18 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
LINGO4Q6UY18 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINGO4Q6UY18 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINGO4Q6UY18 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINGO4Q6UY18 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINGO4Q6UY18 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
LINGO4Q6UY18 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINGO4Q6UY18 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINGO4Q6UY18 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LINGO4Q6UY18 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINGO4Q6UY18 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINGO4Q6UY18 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINGO4Q6UY18 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINGO4Q6UY18 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINGO4Q6UY18 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINGO4Q6UY18 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINGO4Q6UY18 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINGO4Q6UY18 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINGO4Q6UY18 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINGO4Q6UY18 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINGO4Q6UY18 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINGO4Q6UY18 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINGO4Q6UY18 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINGO4Q6UY18 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
LINGO4Q6UY18 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
LINGO4Q6UY18 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINGO4Q6UY18 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINGO4Q6UY18 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINGO4Q6UY18 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINGO4Q6UY18 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINGO4Q6UY18 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINGO4Q6UY18 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINGO4Q6UY18 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINGO4Q6UY18 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINGO4Q6UY18 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINGO4Q6UY18 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LINGO4Q6UY18 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINGO4Q6UY18 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINGO4Q6UY18 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINGO4Q6UY18 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINGO4Q6UY18 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINGO4Q6UY18 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINGO4Q6UY18 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINGO4Q6UY18 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINGO4Q6UY18 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINGO4Q6UY18 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINGO4Q6UY18 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINGO4Q6UY18 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINGO4Q6UY18 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINGO4Q6UY18 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINGO4Q6UY18 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINGO4Q6UY18 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINGO4Q6UY18 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINGO4Q6UY18 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINGO4Q6UY18 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINGO4Q6UY18 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LINGO4Q6UY18 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
LINGO4Q6UY18 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
LINGO4Q6UY18 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINGO4Q6UY18 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINGO4Q6UY18 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINGO4Q6UY18 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINGO4Q6UY18 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINGO4Q6UY18 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINGO4Q6UY18 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINGO4Q6UY18 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINGO4Q6UY18 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINGO4Q6UY18 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINGO4Q6UY18 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINGO4Q6UY18 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
LINGO4Q6UY18 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINGO4Q6UY18 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINGO4Q6UY18 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINGO4Q6UY18 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINGO4Q6UY18 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINGO4Q6UY18 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINGO4Q6UY18 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINGO4Q6UY18 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINGO4Q6UY18 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LINGO4Q6UY18 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.8 ms